La primera aparición del grupo, formado por los mutantes adolescentes, se produjo en el Uncanny X-Men nº 1.³ Oficialmente eran estudiantes de la Escuela Xavier para Jóvenes Talentos, un instituto para superdotados, que les servía de camuflaje para mantener el secreto de sus identidades. Mientras, Charles Xavier un mutante con grandes poderestelepáticos les enseñaba a utilizarlos. Sus primeras aventuras fueron, en su mayoría, enfrentamientos con su archienemigo, también mutante, Magneto y con su Hermandad de mutantes: una organización creada por Magneto para ayudarle en su lucha contra el Homo Sapiens para someterlo bajo su liderazgo.

En esta primera etapa se presentan personajes como Mercurio y la Bruja Escarlata (que originalmente formaron parte de la Hermandad y posteriormente de Los Vengadores), Sean Cassidy (Banshee), Mímico, Kaos y Polaris, Mente Maestra, los Centinelas, el Monolito Viviente y lugares como La Tierra Salvaje. En el apartado artístico, tras la partida deJack Kirby trabajaron Don Heck (con diferentes entintadores) o Neal Adams, que sin duda marcarían el final de esta época. Los primeros guiones estuvieron a cargo de Stan Lee, y tras su marcha le relevóRoy Thomas, aunque Stan siguió ejerciendo control sobre los guiones de su sucesor. Contrariamente a los deseos de Thomas, Stan Lee obligó a que Banshee fuera un hombre, y que Mímico no se sumara como nuevo miembro estable del grupo.

La revista fue cancelada en el número 66 por sus escasas ventas, aunque se realizaron algunas reediciones del material antiguo en su lugar. El personaje de la Bestia fue tratado por el autor Steve Englehart, que realizó una serie en solitario con él en las páginas de "Amazing Adventures", en donde alteraría el aspecto físico del personaje.